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comment trouver la séquence d’un gène ?

Comment trouver la séquence d’un gène ?
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Le séquençage des génomes est une technique courante dans les laboratoires de biologie qui consiste à déterminer l’ordre des nucléotides dans une molécule d’ADN. Cette méthode utilise les connaissances acquises sur les mécanismes de réplication de l’ADN au cours des dernières décennies. Si vous souhaitez trouver la séquence d’un gène, voici les étapes à suivre.

### Fragmentation aléatoire du génome

La première étape du séquençage d’un génome consiste à fragmenter l’ADN de manière aléatoire en morceaux de quelques milliers de paires de bases, ce qui facilite la manipulation. Les extrémités d’un grand nombre de ces petits fragments sont alors séquencées. ([Planet-Vie](https://planet-vie.ens.fr/thematiques/manipulations-en-laboratoire/le-sequencage-des-genomes))

### Déterminer ou confirmer la séquence d’un gène

Vous cherchez à connaître ou à vérifier la séquence du génome d’un organisme ? BIOMNIGENE peut vous aider en réalisant du séquençage De novo (si l’organisme étudié n’a pas encore été séquencé) ou du re-séquençage (si le génome est référencé). ([Biomnigene](https://www.biomnigene.fr/fr/vos-besoins/analyser-une-sequence-genetique/determiner-ou-confirmer-la-sequence-d-un-gene-ou-d-un-genome-entier.html))

### Trouver une séquence promotrice d’un gène

Une séquence promotrice d’un gène est localisée entre 0 et 2500 pb (paire de bases) avant le début du gène. La méthode proposée ici utilise des fragments de 200 pb. ([Futura](https://forums.futura-sciences.com/biologie/402736-trouver-une-sequence-promotrice-dun-gene.html))

### Le séquençage de l’ADN pour les nuls

Pour le séquençage, tout se passe initialement dans un tube à essai, en présence des acteurs de la synthèse de l’ADN : de l’ADN à séquencer, des nucléotides, une amorce et de l’ADN polymérase. ([SVT Lyon](https://svt.enseigne.ac-lyon.fr/spip/IMG/pdf/FT_NCBI1.pdf))

### Recherche de séquences nucléotidiques sur le site NCBI

Pour rechercher des séquences nucléotidiques sur le site NCBI, il suffit de suivre ces étapes :

1. Utiliser le lien FASTA pour faire apparaître la séquence du gène
2. Trouver l’ARNm correspondant à la séquence du gène et visualiser les exons : Utiliser le lien GENBANK pour faire apparaître les informations sur le gène. Trouver la ligne mRNA et cliquer sur le numéro de référence du gène. ([Planet-Vie](https://planet-vie.ens.fr/thematiques/manipulations-en-laboratoire/le-sequencage-d-un-adn))

En suivant ces étapes, vous devriez être en mesure de trouver la séquence du gène qui vous intéresse. Bonne chance !